どちらでも結構ですが、イラストレータCS以降であればpsdでOKです。
以前は「eps保存」が標準でDTP業界では当然の了解事項でしたがイラストレータCS以降であればpsdの配置画像の方が簡易プリンタでも画像がきれいに出力できますし、印刷用に校了後eps保存に別名保存しなくてもいいのでお勧めです。
但し、画像はかならず表示レイヤーを結合してアルファチャンネルなどは削除してください。